Dibināta 30.08.1993. ar LR Zemkopības ministrijas pavēli Nr.23.Galvenās funkcijas : nodrošināt pārtikas aprites uzradzību un kontroli jebkurā tās ražošanas un realizācijas stadijā neatkarīgi no uzņēmējdarbības formējumiem.Saskaņā ar LR MK 13.10. 1999 rīkojumu Nr.472 un LR ZM 04.11.1999 rīkojumu Nr.288 "Par Pārtikas produkcijas kvalitātes valsts inspekcijas un Valsts labības inspekcijas reorganizēšanu ar 01.01.2000 uz to iestāžu bāzes tika izveidots LR ZM pārraudzībā Augkopības produkcijas kvalitātes valsts kontroles dienests.
